Los paneles de secuenciación de cáncer son herramientas moleculares clave en oncología moderna. Permiten detectar alteraciones genéticas relevantes para diagnóstico, pronóstico y selección de terapias dirigidas. En este artículo explico qué es un panel de secuenciación oncológica, cómo funciona para identificar mutaciones y en qué situaciones un paciente debería plantearse realizarlo.
¿Qué es un panel de secuenciación de cáncer?
Un panel de secuenciación de cáncer (panel oncológico de NGS) es una prueba genómica dirigida que analiza de manera simultánea un conjunto definido de genes implicados en el desarrollo, progresión o respuesta terapéutica del cáncer. A diferencia del secuenciado genómico completo, los paneles se centran en genes con relevancia clínica —mutaciones accionables, fusiones, amplificaciones y deleciones—, lo que permite obtener información aplicable a la toma de decisiones clínicas de forma más rápida y económica.
Cómo funciona un panel de secuenciación de cáncer para identificar mutaciones
- Obtención de la muestra: tejido tumoral (biopsia fresca o formalin‑fijada/parafina —FFPE) o muestras líquidas como ctDNA (ADN tumoral circulante) en plasma.
- Preparación y extracción de ADN/ARN: purificación de ácidos nucleicos adecuados para la técnica.
- Enriquecimiento de la región objetivo: mediante captura por hibridación o amplificación por PCR se seleccionan los exones/genes incluidos en el panel.
- Secuenciación massively parallel (NGS): las moléculas enriquecidas se secuencian en paralelo, generando lecturas cortas que cubren las regiones objetivo con profundidad elevada.
- Análisis bioinformático: alineamiento de lecturas contra el genoma de referencia, detección de variantes (SNVs, indels), reordenamientos y copias, y filtrado según calidad.
- Interpretación clínica: las variantes se clasifican según evidencia clínica (patogénicas, probablemente patogénicas, de significado incierto) y se informa sobre mutaciones accionables, opciones terapéuticas, ensayos clínicos y relevancia pronóstica.
- Validación y reporte: controles de calidad, validación de hallazgos críticos (cuando procede) y generación de un informe clínico con recomendaciones.
Principales tipos de alteraciones detectadas
- Mutaciones puntuales (SNVs) y pequeñas inserciones/deleciones (indels).
- Variaciones en el número de copias (amplificaciones o deleciones).
- Reordenamientos/fusiones génicas (p. ej., ALK, ROS1).
- Alteraciones en genes reparadores del ADN (BRCA1/2, MMR) y firmas genómicas (TMB, MSI cuando el panel lo permite).
- En pruebas líquidas: identificación de ctDNA con perfiles mutacionales representativos del tumor.
En resumen, es un test NGS focalizado que analiza múltiples genes relevantes en cáncer para detectar alteraciones genéticas clínicamente relevantes que pueden guiar diagnóstico, tratamiento y seguimiento.
¿Cuándo debe un paciente considerar someterse a un panel de secuenciación del cáncer?
Un paciente debería considerar la realización de un panel de secuenciación oncológica en las siguientes situaciones:
- Diagnóstico de cáncer avanzado o metastásico: para identificar mutaciones accionables que permitan terapias dirigidas o inmunoterapia.
- Tumores con opciones terapéuticas dirigidas conocidas: cuando existen tratamientos aprobados o ensayos clínicos dirigidos a alteraciones genómicas específicas (p. ej., EGFR, ALK, BRAF, BRCA).
- Recaída o progresión tras terapia estándar: para detectar mecanismos de resistencia y escoger tratamientos de segunda línea o ensayo clínico adecuado.
- Pacientes con sospecha de síndrome hereditario asociado a cáncer: si la prueba incluye genes de predisposición o se complementa con pruebas germinales.
- Cuando se busca monitorización no invasiva: uso de paneles en líquido (ctDNA) para seguimiento de respuesta y detección temprana de recidiva.
- Selección para ensayos clínicos basados en biomarcadores: muchos estudios requieren la presencia de alteraciones específicas.
Casos de diagnóstico incierto o tumores raros donde la genómica puede aportar información diagnóstica o conductual.
Conclusión
Los paneles de secuenciación de cáncer son herramientas prácticas y potentes para identificar alteraciones genómicas relevantes que guían decisiones terapéuticas y de seguimiento. Deben considerarse especialmente en cáncer avanzado/metastásico, progresión tras tratamiento, sospecha de predisposición hereditaria o para selección de ensayos clínicos. La elección del tipo de panel, la calidad de la muestra y la interpretación clínica adecuada son esenciales para maximizar el valor clínico de la prueba.
